文献分享--食管癌发生的单细胞多阶段空间演化图谱（Xenium）
文献分享–食管癌发生的单细胞多阶段空间演化图谱（Xenium） by 单细胞空间交响乐 作者，Evil Genius科研之路，并不平坦，唯有坚持，才有胜算。今日参考文献知识积累癌症的发展涉及癌细胞及其周围微环境的共同进化。基因组学和单细胞转录组学的最新进展揭示了肿瘤细胞中突变（TP53、NOTCH1等）的关键作用以及上皮细胞和基质细胞群体之间在驱动癌发展和进展中的复杂相互作用。高分辨率的空间转录组学分析来系统地绘制出癌变过程中细胞状态的空间动态（Xenium）。结果1、多阶段空间转录组学分析揭示ESCC发展中的细胞排布对来自43名代表ESCC发展多个阶段的患者的总共127个FOV进行了空间转录组学分析，其中包括45名正常食管上皮（NOR），25名LGIN，21名HGIN和36名ESCC FOV。300基因探针的Xenium空间技术。结果2、增殖性和侵袭性上皮细胞亚群的扩张驱动ESCC的发展为了描绘上皮细胞在肿瘤发生过程中的演变，分析了ESCC发展多个阶段的4个主要亚群，共1923352个上皮细胞，每个上皮细胞亚群表现出不同的表达谱，并使用来自多阶段样品的scRNAseq数据进一步验证。分析发现，在NOR期，复层鳞状上皮是完整的，具有连续的基底膜，并且三个上皮细胞亚群位于其上方。在NOR期，上皮层再生所必需的基底细胞和增殖细胞主要位于上皮-间质界面附近，分别占上皮厚度的6.